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Recherche bio-informatique sur la tuberculose - Centre National de la Recherche Scientifique


Par Robin Gilles Maxime DEBRY
avril 2018 / novembre 2023
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie
Cadre
Stage
Soft skills mobilisées
Localisation
Orsay, France
Documents associés

Vers une meilleure compréhension de la génétique spatiale et temporelle de la tuberculose, un modèle d’étude de la coévolution entre hôtes et agents pathogènes. Application à l’étude de la tuberculose en Asie.

Étude bio-informatique de l'évolution des différentes lignées et sous-lignées de la tuberculose (Mycobacterium tuberculosis ou bacille de Koch) en Inde, du milieu du XXème siècle à nos jours.

Objectifs

La tuberculose humaine et animale est transmise par Mycobacterium tuberculosis complexe. Sept lignées (L1-L7) ont été décrites. Le taux d’évolution moléculaire est encore controversé, mais l’analyse des séquences répétées a permis une analyse fine de la structure des populations de bacilles dans le monde au cours des 20 dernières années.

L’objet du stage est de reconstruire des cartes de génétique géographique utilisant des logiciels de systèmes d’information géographique (SIG), afin d’identifier les barrières locales de gradients génétiques entre L1-L7, telles qu’elles seront mis en évidence où l’accumulation de données devrait permettre de corréler finement la structure des populations humaines et celle des populations de bacilles, et d’en tirer de nouvelles hypothèses de travail sur l’origine et l’histoire biogéographique de l’évolution de la maladie tuberculose. L’étudiant préparera ses données et les interprètera en se focalisant sur un ou deux modèles de territoires immenses et où les données sont nombreuses : l’Inde et le Brésil.


Services de santé · Partage des connaissances · Microsoft Office · Analytique · Analytique de données · Compétences interpersonnelles · Bureautique · Planification des communications · Biologie · Sens de l’organisation · Connaissances en informatique · Recherche.

Résultats obtenus

Les 4 points de la conclusion :

• La tuberculose constitut une menace biologique d’ordre mondial à laquelle il faut remédier au plus vite ;

• L’acquisition de données spatio-temporelles sur les populations de Mycobacterium tuberculosis est nécessaire pour étudier l’évolution de cet agent pathogène ;

• Des études sur la coévolution entre le bacille tuberculeux et l’homme sont nécessaires pour déterminer les facteurs à risques afin d’endiguer la progression de la maladie ;

• Il existe encore des espaces, en Inde ou ailleurs, où les données sur la diversité des lignées de tuberculose sont manquantes, voire inexistante, ce qui empêche la communauté scientifique d’avoir une bonne visibilité sur le problème.

Objectifs de développement durable

Actions menées dans ce projet

Analyser ses échecs pour développer sa résilience
Cadre
Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie

La résilience est la capacité à analyser la cause d'un échec et à mener des actions correctrices avec enthousiasme et énergie pour atteindre l'objectif.

Établir la liste des situations d’échecs que vous avez vécues.
Pour chacune de ces situations, explicitez par écrit la manière dont vous avez réagi. 

A l'avenir, en situation d’échec, que pourriez-vous changer pour mieux rebondir ? 

Vous pouvez réaliser un inventaire d’échecs même les plus petits et identifier le rebond : analyse ? abandon ? action ? 
Réalisez cet inventaire sans jugement, seulement pour comprendre votre mode de fonctionnement et comment s'améliorer pour mieux vivre la situation d’échec.

Animer une réunion
Cadre
Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie
Pour animer une réunion, il faut l'avoir préparée ! Voir l'action 'préparer une réunion'.

Définir le cadre de la réunion : 
  • rappeler les règles : éteindre les portables, s'écouter…
  • donner le timing
  • valider avant de poursuivre que le cadre est clair pour tous

Une fois la réunion lancée : 
  • exposer clairement les sujets
  • donner la parole à chacun
  • laisser la place à l'argumentation
  • désigner un rapporteur pour prendre des notes et rédiger le compte rendu

Clôturer la réunion : c'est une étape essentielle de la réunion.
Il faut s'assurer que chacun reparte avec une vision claire des prochaines étapes, les actions à mener et le timing à tenir.

Après la réunion : diffuser le compte rendu.

Animer une réunion pour présenter un projet aux parties prenantes
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Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie
Raconter, expliquer les enjeux et le déroulé, écouter les réactions, faire passer des messages.

Cette action a lieu en application d'un plan de communication déjà préparé.

La base des supports de présentation et des éléments de langage existent déjà.

Apprendre à convaincre
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Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie

D'une personne en particulier à une assemblée de centaines d'individus, apprendre à embarquer votre interlocuteur vous permettra de parvenir à convaincre et atteindre vos objectifs. 

Avant toute chose, identifiez votre objectif principal et imaginez une manière de l'exprimer. 
La capacité à convaincre passe par une analyse et adaptation à l'autre. 

Cf. action : "Réaliser une analyse de cible"

  • Identifiez un objectif et une personne ou public cible 
  • Analysez et cernez les attentes et envies de votre interlocuteur 
  • Imaginez et adaptez votre discours et vos actions 

Ressource utile :  

Apprendre à faire confiance à son équipe
Cadre
Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie

La confiance, ça se gagne. 

Il faut savoir positionner le curseur pour ne pas que vous l'accordiez trop facilement, tout en sachant vous fier aux personnes avec lesquelles vous travaillez. 
Déléguez des tâches petit à petit à des membres de votre équipe.


  • Déléguez des tâches progressivement dans un travail 
  • Apprenez à jouer collectif dans le sport, à vous de faire les passes décisives !
  • Testez vous dans un parcours à l'aveugle en laissant un collègue vous guider à la voix

Apprendre à mieux connaître ses co-équipiers pour renforcer la cohésion
Cadre
Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie

Avoir le sens du collectif, c'est savoir écouter l'autre, éprouver de l'empathie, être solidaire et surtout servir l'intérêt de l'organisation/son équipe/son service ou projet avant le sien. S'intéresser aux membres de son équipe, participer à la bonne ambiance de son service sont des façons d'être attentif à la qualité des relations au sein du collectif et contribue à renforcer cohésion et esprit de groupe.

Pour développer le sens du collectif, il est important de bien se connaître entre co-équipiers. Relevez le défi d'être attentif aux personnes avec qui vous travaillez en vous intéressant à leurs passions, leurs centres d'intérêts. 
Pour cela, multipliez les occasions informelles de passer du temps avec vos co-équipiers pour apprendre à les connaître au plan personnel : avez-vous déjà pris un café ensemble à la pause, un verre en fin de journée, partager un déjeuner avec chacun des membres de l'équipe, fait un bout de chemin ensemble pour rentrer... ? 
Questionnez-les sur ce qu'ils aiment, sur ce qu'ils font le week-end.
Partagez avec vos co-équipiers les informations que vous récupérez sur ce qui les intéresse
Peut-être pouvez-vous aller encore plus loin en participant à la bonne ambiance du service en proposant des idées de séminaire, de sorties en équipes, de "repas" de noël ou d'anniversaire en lien avec les intérêts ou passions des membres de l'équipe.

Apprendre à se détendre
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Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie
Identifier une activité qui vous permet de vous relaxer.

L'objectif est de prendre soin de soi, en trouvant un équilibre entre les moments de travail et vos impératifs personnels.

  • Identifier une activité ayant une action bénéfique de relaxation sur votre équilibre de vie.
  • Respecter une pratique régulière

Ressource utile : 

Concevoir le plan de valorisation d'un projet.
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Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie

Après avoir réalisé un projet ou une mission, réfléchir aux actions qui permettront de le valoriser, en choisir quelques unes à mettre en oeuvre, en fonction de l'importance du projet et de votre temps disponible .


Créer un calendrier d'étapes pour un projet
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Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie

Le choix de votre projet doit se faire en cohérence avec vos aspirations personnelles et professionnelles. En tant que coordinateur ou planificateur du projet, vous êtes le garant d'un calendrier d'étapes : vous veillez à ce que chaque membre dispose des outils nécessaires pour respecter les étapes du projet, vous rédigez des comptes rendus succincts réguliers et êtes à l'écoute de chacun des membres de l'équipe projet pour favoriser autonomie et coopération.

Pour mener à bien cette action, il faut : 
- Connaître l'équipe : leurs aptitudes, motivations et compétences de chaque membre de l'équipe
- Proposer un calendrier d'étapes (retroplanning) du projet commun 
- Réaliser des points d'étapes et documenter par des comptes rendus succincts. 
- Etre à l'écoute des besoins de l'équipe sur le terrain pour régler les problèmes liés au projet et au fur et à mesure qu'ils se présentent
- Favoriser la communication et la coopération en cultivant les relations. 

Cette action développera vos compétences d'organisation, de communication, d'anticipation, de rigueur et de communication. 

Ressources utiles : 
- Outil diagramme de Gantt : www.diagramme-de-gantt.fr


Découvrir et développer mon intelligence émotionnelle
Cadre
Stage
Domaine de pratique
Innovation & Ingénierie

La gestion des émotions donne certaines clés pour ne plus subir ses émotions et sortir de blocages. Les émotions sont des messages, des réactions face à des situations qu’il est important d’écouter et de prendre en compte pour pouvoir réagir avec discernement.

Se former ou s'autoformer, via un stage, un atelier découverte ou une ressource en ligne apprend à reconnaître ses émotions et à modifier leur impact sur soi. Grâce à des exercices de visualisation, de respiration et de relaxation, les participants se préparent à accueillir une émotion et à choisir celle qui est la plus appropriée pour reprendre le pouvoir sur eux et gérer au mieux les conflits, les changements, les challenges, les relations…

Objectif global 
Développer votre intelligence émotionnelle afin de : 
- Comprendre les mécanismes des émotions
- Analyser l’impact des émotions dans la relation à l’autre
- Mobiliser les outils de gestion des émotions, se poser et ainsi être assertif et réagir de manière appropriée lors d'un travail de groupe, un projet, un changement etc... 

Ressources utiles : 
- Prendre conseil auprès du Career Centre de votre Campus
- Vidéos Youtube : "Intelligence émotionnelle : 6 étapes pour gérer ses émotions" de Daniel Goleman. "L'intelligence émotionnelle: quelle utilité dans l'entreprise? "